Ο Πανθρακικός στους τελευταίους 3 αγώνες που είχε να δώσει για το πρωτάθλημα της Football League είχε να φιλοξενήσει 2 ομάδες (Ηλιούπολη και Πιερικό) ενώ ταξίδευε και 1 φορά στην Θεσσαλονίκη για να αντιμετωπίσει τον Αγροτικό Αστέρα. Πέρα όμως από τα αγωνιστικά θέματα οι Κομοτηναίοι είχαν την προσοχή τους και στο θέμα των αδειοδοτήσεων καθώς σύμφωνα με την προκήρυξη όλες οι ομάδες που θα συμμετείχαν στα play off έπρεπε να πληρούν τα κριτήρια της UEFA. Όποια ομάδα δεν τα πληρούσε έδινε αυτόματα την θέση της στην επόμενη.
Για την 32η αγωνιστική ο Πανθρακικός φιλοξένησε την Ηλιούπολη και ξεκίνησε την συνάντηση με τους καλύτερους δυνατούς οιωνούς αφού προηγήθηκε στο 8ο λεπτό με τον Ρομπέρ. Λίγα λεπτά αργότερα ο διαιτητής της συνάντησης κ. Ζαχαριάδης απέβαλλε τον Κανωτίδη ενώ στο 13ο λεπτό ο Ηλιόπουλος ισοφάρισε για τους φιλοξενούμενους. Ο Πανθρακικός στο υπόλοιπο του αγώνα έδειξε αποφασιστικότητα και κατάφερε να πάρει την νίκη με 3-1 χάρη στα τέρματα που σημείωσαν οι Τζιωρτζιόπουλος και Ρομπέρ με εύστοχη εκτέλεση πέναλτι.
Στην προτελευταία αγωνιστική της Football League ο Πανθρακικός ταξίδευε στην Θεσσαλονίκη για να αντιμετωπίσει τον Αγροτικό Αστέρα. Το τελικό 2-0 ήρθε με 2 τέρματα που πέτυχαν οι γηπεδούχοι στο διάστημα 65ο έως 68ο λεπτό με τους Τσουκαλίδη και Στεφανίδη. Μια ήττα που ήταν και η πρώτη για τον Πανθρακικό από την μέρα που ανέλαβε ο Σάββας Παντελίδης τα ηνία του συλλόγου.
Στο τελευταίο παιχνίδι της κανονικής διάρκειας του πρωταθλήματος ο Πανθρακικός φιλοξενούσε τον Πιερικό στο Δημοτικό Στάδιο Κομοτηνής. Μετά από ένα στείρο πρώτο ημίχρονο ο Πανθρακικός έδειξε μεγαλύτερη αποφασιστικότητα στο δεύτερο μέρος πετυχαίνοντας 3 τέρματα. Ο Γιώργος Ζησόπουλος στο 56ο λεπτό άνοιξε το σκορ για να διαμορφώσει το τελικό 3-0 ο Γιάννης Γωνιάδης με 2 τέρματα στο 82ο και 89ο λεπτό της συνάντησης.
Ο Πανθρακικός με την συμπλήρωση 34 αγωνιστικών είχε τερματίσει στην 8η θέση της κανονικής διάρκειας του πρωταθλήματος με 47 βαθμούς, 13 νίκες, 8 ισοπαλίες και 13 ήττες με 36 τέρματα υπέρ και 38 κατά.
Στο θέμα των αδειοδοτήσεων η Ελληνική Ποδοσφαιρική Ομοσπονδία μέσω της Επιτροπής της που ήταν υπεύθυνη για το συγκεκριμένα θέμα απέρριψε τις αιτήσεις του ΟΦΗ και των Τρικάλων με αποτέλεσμα ο Πανθρακικός και η Βέροια να πάρουν τις θέσεις τους. Μαζί με τους Λεβαδειακό και Δόξα Δράμας θα αποτελούσαν την 4αδα που είχε ως έπαθλο το ένα και μοναδικό εισιτήριο που θα έδινε την άνοδο στο πρωτάθλημα της Super League.